Dentro de la fauna del cantón Eloy Alfaro, existe gran cantidad de animales de selva; sin embargo, muchos de ellos han sido extremadamente explotados mediante la cacería, por lo que ciertas especies están prácticamente en peligro de extinción. Dentro de estas especies de animales existentes tenemos:

MAMIFEROS

• Tuta mono
• Raposa
• Machín
• Ardilla
• Cuchucho
• Armadillo
• Puma
• Soche  venado
• Ratón espinoso
• Mono Aullador
• Guatín
• Ocelote
• Jaguar
• Cusumbo
• Guanta
• Conejo
• Oso
• Tapir o Danta
• Erizo
• Mono Barrigón

AVES

• Pava
• Quinde Café
• Trompetero
• Tucán
• Guacamayo
• Lora
• Carpintero
• Lechuza
• Gavilán del Sol
• Rayo Quinde

REPTILES

• Caimán
• Boa Esmeralda
• Coral
• Lagarto
• Tortuga